La désignation définitive des Zones Spéciales de Conservation (ZSC) va de pair avec la fixation d’objectifs de conservation. Ces objectifs, quantitatifs et qualitatifs, précisent les valeurs cibles et les exigences écologiques requises pour parvenir à l’état de conservation proposé. Les objectifs de conservation sont entérinés par le Gouvernement régional, dans ses arrêtés de désignation, après avoir été soumis à une enquête publique.

Depuis 2010, des rapports préparatoires sur les objectifs de conservation des trois ZSC sont finalisés et traduits pour servir de base à l'élaboration des arrêtés de désignation définitive des ZSC.

Les objectifs de conservation constituent un cadre d’évaluation très important, aussi bien pour les rapports à fournir tous les 6 ans à la Commission européenne sur l’avancement du projet Natura 2000 que pour tout plan ou projet susceptible d’avoir une incidence négative sur un site Natura 2000, et pour lequel il faut donc réaliser une évaluation appropriée.

En plus des objectifs de conservation établis pour chacune des 3 ZSC, des plans de gestion sont établis par station Natura 2000. Une station correspond souvent aux limites d’un parc (comme le Parc de Woluwé) ou d'un grand domaine privé (tel que le château Charles-Albert). Au total, les 3 ZSC sont constituées de 48 stations. Les plans de gestion décrivent en détail les mesures de gestion nécessaires pour y parvenir à un état de conservation favorable.